辦公室 黨的建設工作領導小組辦公室 人事處 財務處 規劃與信息處 政策法規處 體制改革處 疾病預防控制處 醫政醫管處 基層衛生處 衛生應急辦公室 科技教育處 綜合監督處 藥物政策與基本藥物制度處 食品安全標準與監測評估處 婦幼健康服務處 職業健康處 人口監測與家庭發展處 國際合作處 老齡健康處（健康產業促進處） 中醫藥發展處 宣傳處 中醫藥服務管理處 機關黨委 離退休工作處